Il dipartimento di scienze economiche afferisce ai seguenti centri interdisciplinari e strutture complesse dell'Università di Bologna.
Centro interdipartimentale "L. Galvani" (C.I.G.) per studi integrati di bioinformatica, biofisica e biocomplessità
Centro Interdipartimentale di ricerca in epistemologia e storia delle scienze CIRESS
Scuola superiore di politiche per la salute
- La scuola nasce per iniziativa del dipartimento di medicina e sanità pubblica, di discipline economico-aziendali, di scienze economiche e della scuola di specializzazione in studi sull'amministrazione pubblica.
Scuola superiore di scienze turistiche
- La scuola nasce presso la sede del polo scientifico e didattico di Rimini e si presenta come una piattaforma ideale per raccogliere e sviluppare ricerca e formazione e per offrire consulenza in campo turistico.